学科: 基因工程

目前尚不清楚CRISPR编辑结果在基因组中的差异，以及结构变异（SV）等不良事件是否可预测或预防。本研究对1875个经CRISPR-Cas9编辑的酵母克隆进行全基因组测序，发现非预期编辑（包括SV）富集于特定基因组区域，开发出预测模型SCORE，识别出占基因组4.8%的562个SV热点。增强供体修复策略可抑制中度风险区域的SV形成。将SCORE应用于合成酵母基因组Sc2.0，发现其SV景观因重复序列移除和loxP插入而改变。该研究提供了CRISPR编辑后SV热点的全基因组图谱及缓解工具。

标签: CRISPR编辑 合成基因组 结构变异 酵母基因组 预测模型