南太平洋金枪鱼(大眼金枪鱼)的完整基因组图谱
作者: aeks | 发布时间: 2026-10-27 04:02 | 更新时间: 2026-10-27 04:02
学科分类: 水产
南太平洋金枪鱼(大眼金枪鱼)的完整基因组图谱
长鳍金枪鱼(Thunnus alalunga)是一种广泛分布于亚热带和温带海域的重要远洋经济鱼类。本研究结合PacBio HiFi高精度长读长测序与Hi-C三维基因组构象技术,成功构建了其染色体级别的高质量基因组。最终组装完成的基因组大小约为809.18兆碱基(Mb),连续片段(contig)N50达33.53 Mb,意味着一半以上的组装序列长度超过3300万碱基,质量非常高;利用Hi-C数据,99.85%的序列被精准锚定到24条假染色体上(对应其二倍体染色体数目),实现了接近完整的染色体水平定位。通过BUSCO评估,基因组完整性达99.40%,说明绝大多数保守的必需基因都已完整收录。研究共预测出24,432个蛋白质编码基因,其中99.74%已获得功能注释(即知道它们大致参与哪些生物过程);重复序列占全基因组的29.22%(约235.42 Mb),符合多数硬骨鱼类特征。这一高质量基因组资源,将有力支撑未来关于长鳍金枪鱼演化历史、种群结构动态、遗传多样性变化等方面的研究,尤其有助于科学评估全球变暖和日益加剧的人类活动(如过度捕捞、海洋污染)对其生存带来的长期影响,从而为制定可持续渔业管理和保护策略提供坚实的数据基础。