病毒版“乐高地图”来了!AlphaFold2一口气拼出2.7万个病毒蛋白3D模型,跨宿主同款折叠惊呆科研圈
作者: aeks | 发布时间: 2025-10-04 22:32 | 更新时间: 2025-10-04 22:32

病毒蛋白也能撞衫?我熬夜刷完这篇Science Advances,直接原地起鸡皮疙瘩——原来噬菌体和感染人类的病毒,居然共用同一套“祖传乐高说明书”!今天用大白话给大家拆解这篇神作,顺便把数据库链接甩给你们,拿去玩!
🧬 先上硬菜:病毒AlphaFold数据库(VAD)
- 数据来源:64万条病毒蛋白序列→聚类→AlphaFold2预测
- 成品:2.7万个高质量单体+同源二聚体结构
- 覆盖范围:细菌、古菌、真核生物的病毒一网打尽
- DOI指路:10.1126/sciadv.adz8560(想深挖的宝子直接冲)
🎯 三个炸裂发现
1️⃣ 跨宿主撞衫现场
感染细菌的病毒和感染植物的病毒,蛋白序列差出十条街,3D结构居然复制粘贴?!研究团队锁定核酸代谢酶(DNA甲基转移酶/解旋酶/核苷酸水解酶),发现它们像传家宝一样在不同宿主病毒间流传。
2️⃣ 病毒也爱组CP
同源二聚体预测显示,病毒蛋白超爱“手拉手”!尤其肽基-tRNA水解酶(Pth),从噬菌体到昆虫病毒都在用同款二聚体结构——相当于病毒界的“翻译外挂”,防止宿主细胞罢工。
3️⃣ 黑暗蛋白挖出宝藏
用基因组环境分析法,挖到全新毒素-抗毒素系统KreTA!实验验证:KreT蛋白能让大肠杆菌当场社死,KreA抗毒素立刻救场。这套系统潜伏在前噬菌体区域,堪称病毒版“冬眠开关”。
🛡️ 病毒生存智慧
- 反CRISPR折叠:某些病毒蛋白折叠酷似Acr蛋白,疑似偷师宿主免疫系统
- 信号干扰器:磷酸二酯酶专门破坏宿主环状核苷酸通路,相当于拔掉宿主报警电话
💡 彩蛋时间
数据库已公开!结构生物学家、病毒学家、药学狗速来薅羊毛。下次有人问你病毒蛋白怎么研究,直接把VAD甩过去:“诺,2.7万个3D模型随便挑!”
(P.S. 实验室电阻炉煮的“焦耳版港式奶茶”还剩半锅,来问的宝子请自带杯子,先到先得!)