远古丹尼索瓦人DNA仍在影响现代人的免疫力

尽管南太平洋地区拥有全球最丰富的人群遗传多样性之一，但该区域人群在大型基因组研究中长期被严重忽视——此前多数研究聚焦欧洲血统人群，导致人类演化史和健康相关问题存在大量空白。耶鲁大学人类学助理教授塞尔ena·图奇指出，这种缺失不仅限制我们理解人类演化，还可能加剧医疗健康不平等，因为基于基因组的新型疗法若缺乏南太平洋人群数据，将难以惠及他们。为填补这一空白，研究团队开展大规模项目，重点解析人类遗传变异，尤其是来自已灭绝古人类（如丹尼索瓦人）的遗传片段。

本研究于6月11日发表于《科学》杂志。团队对近大洋洲（包括巴布亚新几内亚、俾斯麦群岛和所罗门群岛）12个族群共177人的全基因组进行测序，并整合全球已发布的1284个基因组数据。通过追溯至少4.5万年前最早定居太平洋的人群，研究发现：近大洋洲人群祖先曾与至少三支不同的丹尼索瓦相关群体发生过混血——这远超此前认知（以往仅知与一支丹尼索瓦人混血）。图奇强调，过去研究只证实古人类DNA“残留在”现代人基因组中；而本研究首次直接证明这些古老DNA片段仍在“活跃工作”：它们能开关基因，切实影响当代人的生物学功能，而非仅是历史遗迹。

为验证其功能，团队采用先进的“大规模并行报告基因检测”技术，系统测试了数万个遗传变异对基因活性的影响，最终鉴定出3100多个能显著改变基因表达的丹尼索瓦来源变异。其中许多变异集中作用于干扰素-γ信号通路——这是人体抵抗病毒和细菌感染的核心免疫机制。第一作者帕特里克·赖利解释：当古人类迁入南太平洋湿热多病原体的环境时，从丹尼索瓦人继承的这类基因变异，极大增强了他们对当地传染病的免疫力，属于典型的适应性进化。

此外，研究还发现丹尼索瓦DNA参与骨骼发育调控，尤其在一个名为TRPS1的基因中识别出具有适应性优势的变异。有趣的是，同一基因在中非雨林狩猎采集者和厄瓜多尔高原人群中也经历了强烈正向选择——说明不同大陆、截然不同的环境中，自然选择可能独立地“选中”相同基因来解决相似生存挑战（如应对高湿度、病原压力或低氧等）。图奇总结道：“丹尼索瓦人虽已在数千年前消失，但他们的基因仍活在我们的细胞里，持续塑造着我们的健康与身体。”

本研究由美国国立普通医学科学研究所（NIGMS）和国家人类基因组研究所（NHGRI）资助，合作单位涵盖耶鲁大学、宾汉姆顿大学、天普大学及巴布亚新几内亚医学研究所等。