人类蛋白质组新成员：微蛋白与肽蛋白

本文是一项多机构合作的重大科研成果，旨在系统性地拓展人类蛋白质组的认知边界。长期以来，科学界主要关注约19500个经典蛋白编码基因，但近年发现大量非经典开放阅读框（ncORFs）也能被翻译成微小蛋白质（微蛋白）。这些微蛋白在癌症生物学、疾病遗传基础及免疫治疗靶点发现中展现出巨大潜力，却因缺乏统一标准而难以被纳入权威基因注释体系。为此，国际TransCODE联盟联合GENCODE、PeptideAtlas、HUPO-HPP等权威项目，共同制定了标准化分析框架与新分类体系。研究团队对95,520个蛋白质组学实验数据进行了大规模分析，证实约25%的7264个ncORFs能产生可检测的肽段；并创新性地提出'肽因'（peptidein）这一概念：指那些已有充分实验证据（如核糖体测序、质谱检测、HLA呈递）证明其确能翻译产生蛋白质，但目前尚无法确认其在正常生理状态下具有明确生物学功能的分子。这既区别于传统意义上的功能蛋白，也不同于无功能的翻译噪声，为这类'中间态'分子提供了科学、严谨的注释身份。研究还开发了'ORF相对分支长度'（ORBL）进化分析新方法，发现许多ncORFs虽缺乏氨基酸序列保守性，却在'阅读框完整性'层面受到显著进化约束，这为其生物学意义提供了独立佐证。最后，研究以OLMALINC长链非编码RNA中的一个肽因（c10riboseqorf92）为例，通过功能基因组学实验证明其缺失会导致细胞增殖严重受损，确证其具有关键的细胞必需功能。全文不仅构建了面向未来研究的公共工具集（已向GENCODE和PeptideAtlas开放），更提出了七项前瞻性研究议程，旨在推动整个领域从基础发现走向生物医学的实际应用。