标签: 基因组组装

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用纠错后的纳米孔测序数据完成端到端的染色体组装

作者: aeks | 发布时间: 2026-04-28 06:02

学科: 生物医学工程 生物工程 计算机科学与技术

本文提出一种新方法HERRO,能大幅提高纳米孔测序数据的准确性,仅用单一测序平台(牛津纳米孔)的超长读长,就可组装出端粒到端粒(T2T)的完整人类染色体,包括X和Y染色体,且成本更低、操作更简单。

标签: 单倍型解析 基因组组装 深度学习纠错 端粒到端粒组装 纳米孔测序

用纳米孔单次测序数据高效组装染色体末端的完整序列

作者: aeks | 发布时间: 2026-02-05 12:05

学科: 生物医学工程 生物工程 计算机科学与技术

端粒到端粒(T2T)组装是从头基因组组装的终极目标。现有方法需昂贵且难获取的ONT超长读长,而新算法hifiasm(ONT)用标准ONT simplex读长即可实现近T2T组装,降低计算需求,重建更多染色体,大幅拓宽T2T组装的应用可行性。

标签: ONT simplex读长 hifiasm (ONT) (hifiasm-ONT) 基因组组装 端粒到端粒组装