抗病毒蛋白“宝库”有望催生强力分子工具

本文报道了两项发表于《科学》杂志的研究，两支团队分别开发了基于机器学习的算法（如DefensePredictor），对数万种细菌基因组进行系统筛查，从而识别出大量参与抗病毒防御的蛋白质。研究发现：细菌基因组中约1.5%的基因编码抗病毒蛋白，是此前估计的3倍；预测出的数十万个潜在抗病毒蛋白中，超85%所属的蛋白家族从未被关联到免疫功能；实验在大肠杆菌和白链霉菌中验证了12种全新‘抗噬菌体’系统。此前已知的细菌抗病毒机制包括CRISPR-Cas9和限制性内切酶，而本次发现预示着更多可被改造为分子工具（如新型基因编辑系统）的天然免疫元件正待挖掘。专家指出，学界长期严重低估了细菌免疫系统的规模与复杂性，此次工作相当于打开了一个巨大的‘分子宝库’。