用人工智能自动追踪细胞移动,更快找到调控因子
作者: aeks | 发布时间: 2026-03-28 21:03 | 更新时间: 2026-03-28 21:03
本文介绍了一种名为DeepBIT(深度学习明场成像与细胞追踪)的新型高通量、无标记细胞迁移分析平台。细胞迁移是免疫防御、组织修复、胚胎发育等生理过程的基础,但其失控也会驱动肿瘤转移。长期以来,迁移研究受限于低通量:传统方法需荧光染色(可能损伤细胞、引发光毒性),或依赖耗时费力的人工追踪(一名熟练人员每小时仅能追踪约50个细胞),难以系统性探索成百上千种药物或基因扰动的影响。DeepBIT巧妙解决了这一难题:它利用明场显微镜拍摄活细胞视频(不干扰细胞自然状态),再通过卷积神经网络(CNN)自动识别并追踪每个细胞核的位置。为训练AI模型,研究人员将明场图像与同步采集的荧光图像(Hoechst染活细胞核、碘化丙啶染死细胞核)配对,自动生成大量精准的“标准答案”数据集,彻底避免了繁琐且主观的手动标注。实验证明,该模型在多种乳腺癌细胞(如MDA-MB-231、MCF-7)上达到98%以上的像素级识别准确率,且在不同焦平面、不同细胞密度下均稳定可靠。使用DeepBIT,单块96孔板可在几分钟内完成2000多个细胞、100个时间点的追踪,效率比人工提升数百倍。研究团队用它系统筛选了96种美国FDA批准的药物(共280种剂量组合),发现其中32种显著影响细胞迁移速度;更关键的是,他们甄别出13种“纯迁移调节剂”——这些药物在不影响细胞存活率和增殖能力的前提下,专门增强或抑制迁移。例如,抗抑郁药雷莫司汀(resminostat)在特定浓度下使癌细胞迁移速度提升约80%,而另一种5-羟色胺受体拮抗剂拉莫塞tron(ramosetron)则被首次证实具有强效抑迁移作用。此外,研究还揭示迁移调控具有极强的“上下文依赖性”:同一种信号分子(如TNF-α或RhoA蛋白),在不同微环境(如有无胶原蛋白、不同血清浓度)下,可能完全相反地影响迁移——有时促进,有时抑制。通过整合CRISPR基因编辑技术,DeepBIT进一步证明,敲除细胞骨架相关基因(如RHOA、ARPC2)的效应也高度依赖外部环境。总之,DeepBIT提供了一个客观、高效、可扩展的工具,让科学家能以前所未有的规模和精度,系统解析细胞迁移的调控网络,为发现抗癌新靶点和开发抗转移疗法开辟了新路径。