一张更精准的癌症关系图：借助新一代3D癌症模型

尽管精准肿瘤学取得进展，但多数癌症患者仍缺乏有效的个性化治疗方案。传统的癌细胞系存在明显局限：难以代表多种癌症亚型，且体外培养环境会干扰药物反应。为此，本研究构建并系统分析了覆盖10种癌症类型的147个新一代3D癌模型（包括类器官和球状体），结合全基因组CRISPR筛选与多组学分析（全基因组测序、RNA测序），显著扩展了“癌症依赖图谱”（DepMap）的覆盖范围。这些新模型不仅能更真实地保留肿瘤特有的基因表达程序（如胶质瘤的“胶质状态”、消化道肿瘤的“黏液分化程序”），还帮助发现了与这些程序紧密关联的新型治疗依赖——例如，胶质瘤中CDK6基因的依赖性与CDKN2A基因缺失相关；消化道类器官对WNT信号通路关键因子（如WLS、MESD）的依赖性则与“黏液分化”状态强相关。研究还发现，细胞生长形态（2D单层 vs. 3D立体）和培养基成分（含血清 vs. 无血清）会特异性影响不同基因的必需性：整合素和肌动蛋白相关基因的依赖性主要受生长形态影响，而脂质代谢相关基因的依赖性则主要受培养基影响。通过整合新旧模型数据，本研究提供了一个更全面、更贴近人体肿瘤的资源库，有助于科学家发现更多可靶向的癌症弱点，推动真正个性化的癌症治疗发展。